İstanbul Kültür Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, 15 Temmuz 1997 tarihinde 4281 sayılı kanunla kurulan İstanbul Kültür Üniversitesi’nin kuruluş şeması içerisinde yer almıştır.
İstanbul Kültür Üniversitesi Lisansüstü Eğitim ve Öğretim Yönetmeliği 5 Şubat 1998 yılında Resmi Gazete’de yayımlanarak yürürlüğe girmiştir. Yeniden hazırlanan yönetmelik ise 10 Haziran 2005 yılında 25841 sayılı Resmi Gazete’de yayımlanarak yürürlüğe konulmuştur.
1999-2000 Öğretim Yılı Bahar Yarıyılında, ilk olarak İnşaat Mühendisliği Yapı ve Proje Yönetimi Yüksek Lisans Programları açılmıştır. 2000-2001 Öğretim Yılı Güz Yarıyılı’nda Matematik-Bilgisayar Yüksek Lisans ve Mimarlık Yüksek Lisans Programları; 2001-2002 Öğretim Yılı Güz Yarıyılında Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans Programı; 2002-2003 Öğretim Yılı Bahar Yarıyılında İç Mimarlık ve Çevre Tasarımı Yüksek Lisans Programları ve 2008-2009 Öğretim Yılı Güz Yarıyılında Fizik Yüksek Lisans Programı açılmıştır.
İnşaat Mühendisliği Doktora Programı 2002 yılında ve Matematik Doktora Programı 2003 yılında başlamıştır.
İstanbul Kültür Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü'nde halen 13 dalda Yüksek Lisans ve 5 dalda Doktora öğretimi;
- Özgün, yaratıcı düşünceye sahip, özgüvenli bireyler yetiştirmek
- Bilimsel ölçütlere mutlak uyum
- Evrensellik
- Saydamlık, titizlik
- Özgün düşünce ile çözüme odaklılık
- Paylaşımcılık
- İşbirliğini özendirmek
- Disiplinler arası programlar geliştirmek
temel değerleri doğrultusunda yapılmaktadır.
İstanbul Kültür Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Doktora ve Yüksek Lisans Programları bilimsel ve analitik düşünceyle, küresel ölçekte iş dünyasının gereksinim duyduğu ileri teknoloji birikimiyle donatılmış profesyoneller yetiştirmeyi; temel bilimler, mühendislik, mimarlık, iç mimarlık ve çevre tasarımı alanlarında ülkemizin, evrensel nitelikte rekabet gücüne sahip araştırmacı potansiyelini arttırmayı amaçlar.